Публікація: Аналіз структур білків за допомогою AlphaFold для дослідження мутацій і їхнього впливу на функції білків у біомедичних застосуваннях
Завантаження...
Дата
2025
Автори
Назва журналу
ISSN журналу
Назва тома
Видавництво
Анотація
Об’єкт дослідження – просторові структури білків людини, що змінюються під впливом мутацій. Предмет дослідження – аналіз впливу мутацій на структуру та функції білків за допомогою алгоритму AlphaFold. Мета роботи – здійснити структурно-функціональний аналіз білків на основі передбачених моделей AlphaFold для оцінки впливу точкових мутацій у біомедичному контексті. Проведено огляд сучасних підходів до аналізу білкових структур і алгоритмів глибинного навчання, зокрема AlphaFold. Описано архітектуру моделі та особливості її роботи з білками з різними типами мутацій. Змодельовано просторові структури чотирьох білків (TP53, CFTR, Spike SARS-CoV-2, лізоцим) у диких і мутантних формах. Виконано порівняння метрик pLDDT, pTM, PAE та TM-score між вихідними і мутантними структурами, виявлено зміни у функціонально важливих ділянках. Проаналізовано вплив мутацій на біологічну активність білків із використанням інструментів FoldX, Rosetta, SIFT, PolyPhen та засобів візуалізації ChimeraX і PyMOL. AlphaFold підтвердив ефективність у передбаченні структур і початковому аналізі мутацій. Результати можуть бути застосовані для ідентифікації терапевтичних мішеней, діагностики та персоналізованої медицини.
Опис
Ключові слова
біомедицина, мутації, структура білка
Бібліографічний опис
Довгоселець Ю. В. Аналіз структур білків за допомогою AlphaFold для дослідження мутацій і їхнього впливу на функції білків у біомедичних застосуваннях : пояснювальна записка до кваліфікаційної роботи здобувача вищої освіти на другому (магістерському) рівні, спеціальність 122 Комп’ютерні науки / Ю. В. Довгоселець ; М-во освіти і науки України, Харків. нац. ун-т радіоелектроніки. – Харків, 2025. – 108 с.